故事原始，黑暗独眼巨人赛罗因曾在银河系中与赛罗奥特曼交战不幸被对手打入虫洞，然而化成陨星掉落到地球的中国广州地区白云山之中沉睡多年被当地的人们供奉为神一样对待。
　　直到有一天一个叫阿杰的男孩子到白云山上游玩看到一个庙堂便好奇进入，由于他的好奇心最后却导致唤醒了独眼巨人并得到了光芒与他一体融合。
　　但让人意料不到的是这个黑暗独眼巨人赛罗竟然变成了正义的体形，而且还消灭了侵略者们并保护地球人，难道是因为他有了人间体的原因！
　　正义化身的独眼赛罗奥特曼接受命运的安排吧！